196 articles
Cette étude de génétique inverse a identifié des variants génétiques spécifiques associés à la capacité fonctionnelle, à la force musculaire et à la charge de la maladie chez les patients atteints de MPOC, révélant que les déficits extrapulmonaires liés à la maladie s'appuient sur une prédisposition génétique préexistante.
Cette étude présente le profil de la cohorte AMBER au sein de Generation Scotland, décrivant la collecte de données auprès de 1 180 participants pour caractériser les réponses aux antidépresseurs et préparer une analyse biologique future visant à comprendre les mécanismes de la variabilité thérapeutique dans la dépression.
Cette étude utilise l'édition génomique de saturation pour évaluer près de 11 000 variants de BARD1, permettant de résoudre plus de 95 % des variants de signification incertaine et de confirmer le rôle crucial de cette protéine dans la suppression tumorale via la réparation de l'ADN.
Cette étude caractérise un nouveau syndrome d'encéphalopathie épileptique et développementale sévère causé par des variants bialléliques rares du gène RNU2-2, en intégrant un phénotypage approfondi et des analyses transcriptomiques sur des fibroblastes qui révèlent des anomalies d'épissage spécifiques.
Cette étude présente le premier catalogue détaillé de variants structuraux chez 61 individus du Moyen-Orient et de l'Afrique du Nord, généré par séquençage nanopore longue lecture, révélant une diversité génétique inédite et améliorant significativement l'interprétation clinique pour les populations de cette région.
Cette étude multicentrique indienne valide l'utilité d'un score de risque génétique de 67 SNPs pour le diabète de type 1 en tant qu'outil diagnostique unifié, tout en soulignant la nécessité d'optimiser ses seuils spécifiques à l'ascendance pour compenser les variations liées à l'âge d'apparition et au statut des auto-anticorps, car les seuils d'origine européenne sous-estiment systématiquement le risque génétique chez les patients indiens.
Cette étude démontre que l'intégration du séquençage de l'ARN dans le diagnostic des maladies mitochondriales permet d'identifier des variants pathogènes cryptiques, tels que des anomalies d'épissage ou des échappements à la dégradation NMD, invisibles aux seules analyses d'ADN, augmentant ainsi considérablement le taux de diagnostic moléculaire.
Cette étude prospective de cas-témoins a utilisé le séquençage de nouvelle génération à haute résolution pour identifier que les allèles HLA-A*02:01, HLA-C*03:03:01, HLA-C*14:03 et HLA-DRB1*04:05 constituent des facteurs de risque génétiques pour l'apnée obstructive du sommeil chez les patients turcs, tandis que les allèles HLA-A*03:01 et HLA-B*35:02 semblent exercer un effet protecteur.
Cette étude suggère que des variants hétérozygotes du gène HSP90AA1 pourraient constituer une cause autosomique dominante de l'infertilité masculine humaine, bien que les mécanismes exacts et la validité clinique nécessitent une confirmation par des cohortes indépendantes.
Cette étude du projet chilien DECIPHERD démontre l'utilité du séquençage de l'exome pour le diagnostic des maladies rares au Chili et identifie que la présence d'anomalies congénitales multiples et de troubles du développement neurologique sont les principaux facteurs prédictifs d'un résultat informatif, tandis que l'ascendance génétique n'influence pas le rendement diagnostique.
Cette étude propose EDGAR, un cadre d'apprentissage profond qui améliore la précision des études d'association pangénomique basées sur les dossiers de santé électroniques en reconstruisant la liability des maladies tout en identifiant et en éliminant les biais génétiques systémiques qui faussent les corrélations entre maladies et traits socio-économiques.
Les auteurs proposent COXMM, un modèle mixte de risques proportionnels de Cox permettant d'estimer sans biais l'héritabilité des traits temporels à partir de données longitudinales, révélant ainsi que la progression vers des conditions sévères est moins héritable que l'incidence globale en raison d'influences environnementales plus fortes.
Cette étude d'association pangénomique transcritomique multi-tissus a identifié 29 gènes de risque associés au trouble du déficit de l'attention avec ou sans hyperactivité (TDAH), dont six nouveaux candidats, offrant ainsi de nouvelles perspectives pour la recherche translationnelle et la découverte de médicaments.
Cet article présente le GPMap, une ressource open-source qui cartographie les associations génétiques colocalisées entre des millions de mesures moléculaires et des milliers de traits complexes pour élucider les mécanismes des maladies, optimiser les inférences causales et prédire le succès des essais cliniques.
Cette étude démontre que l'application de modèles génétiques dominants et récessifs à une analyse d'association pangénomique sur l'fibrose pulmonaire idiopathique a permis d'identifier de nouveaux signaux significatifs, notamment dans les gènes PMF1 et EPN3, offrant ainsi de nouvelles perspectives sur la pathogenèse de la maladie.
Cette étude d'association pangénomique sur 12 systèmes d'organes révèle des mécanismes génétiques partagés et identifie de nouveaux variants associés à la fibrose, ouvrant la voie au développement de thérapies ciblées.
Cette étude démontre que les grands modèles de langage dotés de capacités de raisonnement peuvent automatiser avec une grande précision l'extraction de preuves génomiques cliniques (code PS4) à partir de la littérature, bien que leurs performances dépendent du modèle et du prompt, ce qui justifie l'adoption d'un flux de travail hybride associant l'IA à une validation experte.
Cette étude de 70 724 individus dotés de génotypages HLA haute résolution a permis d'identifier de nouvelles associations, notamment une forte corrélation entre l'allèle HLA-DRB1*04:01 et la sensibilité au céfaclor, démontrant ainsi la valeur de l'intégration de données phénotypiques au-delà des dossiers médicaux électroniques pour révéler des influences immunogénétiques sur des conditions courantes.
Cette étude de méta-analyse génomique portant sur près de 700 000 individus a identifié 80 variants génétiques associés à la sévérité des symptômes d'anxiété généralisée, révélant des corrélations génétiques avec divers troubles mentaux et physiques et soulignant l'importance d'une approche quantitative pour comprendre l'architecture génétique de l'anxiété.
Une étude utilisant la randomisation mendélienne à l'échelle du phénotype révèle que l'expression du gène GLP1R protège contre 58 maladies mais augmente le risque de 34 autres, notamment des problèmes de santé néonatale et des carences en vitamine D, tandis que l'inhibition de la CETP offre une protection cardioprotectrice plus limitée.